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PlantRegMap/PlantTFDB v5.0
Plant Transcription Factor Database
Phylogenetic Tree for
Catharanthus roseus
bHLH Family
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      /------------------------------------------------------------------- cra_locus_16044_iso_1/441-488  (1)
      |                                                                               
      |------------------------------------------------------------------- cra_locus_113547_iso_1/40-87   (2)
      |                                                                               
      |------------------------------------------------------------------- cra_locus_7653_iso_2/195-236   (13)
      |                                                                               
      |------------------------------------------------------------------- cra_locus_10082_iso_3/229-275  (94)
      |                                                                               
      |                                                           /------- cra_locus_9367_iso_3/342-388   (12)
      |                                                   /---56--+                   
      |                                                   |       \------- cra_locus_4594_iso_1/419-465   (70)
      |------------------------100------------------------+                           
      |                                                   |       /------- cra_locus_3040_iso_1/329-373   (33)
      |                                                   \--100--+                   
      |                                                           \------- cra_locus_8576_iso_1/519-564   (50)
      |                                                                               
      |                                                           /------- cra_locus_4548_iso_5/39-85     (5)
      |                                                   /---68--+                   
      |                                                   |       \------- cra_locus_5660_iso_3/54-103    (82)
      |                                            /--97--+                           
      |                                            |      \--------------- cra_locus_5400_iso_2/103-152   (40)
      |                                            |                                  
      |                                            |---------------------- cra_locus_59466_iso_1/67-114   (16)
      |                                            |                                  
      |                                            |---------------------- cra_locus_74591_iso_1/39-86    (24)
      |                                            |                                  
      |                                            |---------------------- cra_locus_10223_iso_4/89-135   (25)
      |                                            |                                  
      |---------------------100--------------------+---------------------- cra_locus_58692_iso_1/71-118   (26)
      |                                            |                                  
      |                                            |              /------- cra_locus_104520_iso_1/30-77   (42)
      |                                            |------87------+                   
      |                                            |              \------- cra_locus_941_iso_5/93-140     (83)
      |                                            |                                  
      |                                            |---------------------- cra_locus_83174_iso_1/29-72    (51)
      |                                            |                                  
      |                                            \---------------------- cra_locus_1344_iso_6/30-77     (69)
      |                                                                               
      |                                                           /------- cra_locus_12822_iso_1/189-234  (4)
      |                                                   /---68--+                   
      |                                                   |       \------- cra_locus_1072_iso_2/114-159   (48)
      |                                            /--59--+                           
      |                                            |      \--------------- cra_locus_2845_iso_5/214-259   (17)
      |                                            |                                  
      |                                            |---------------------- cra_locus_1467_iso_1/173-220   (6)
      |---------------------75---------------------+                                  
      |                                            |---------------------- cra_locus_19483_iso_1/167-214  (35)
      |                                            |                                  
      |                                            \---------------------- cra_locus_30819_iso_1/109-135  (59)
      |                                                                               
      |                                                           /------- cra_locus_14847_iso_4/2-37     (65)
      |                                                           |                   
      |-----------------------------69----------------------------+------- cra_locus_121939_iso_1/57-110  (72)
      |                                                           |                   
      |                                                           \------- cra_locus_12774_iso_1/88-131   (92)
      |                                                                               
      |                                                           /------- cra_locus_31527_iso_2/140-180  (7)
      |                                                   /---96--+                   
      |                                                   |       \------- cra_locus_16649_iso_1/219-259  (19)
      |                                            /--51--+                           
      |                                            |      \--------------- cra_locus_25027_iso_1/45-84    (77)
      |                                    /---84--+                                  
      |                                    |       \---------------------- cra_locus_40960_iso_1/60-100   (93)
      |                             /--89--+                                          
      |                             |      \------------------------------ cra_locus_18990_iso_1/17-62    (71)
      |              /------69------+                                                 
      |              |              \------------------------------------- cra_locus_12546_iso_1/180-220  (96)
      |              |                                                                
      |              |                                    /--------------- cra_locus_7910_iso_2/157-201   (9)
      |              |                                    |                           
      |              |              /----------94---------+       /------- cra_locus_4107_iso_2/164-208   (29)
      |              |              |                     \--100--+                   
      |              |              |                             \------- cra_locus_57960_iso_1/51-98    (30)
      |              |              |                                                 
      |              |              |                             /------- cra_locus_11711_iso_2/161-208  (11)
      |              |              |                             |                   
      |              |              |                             |------- cra_locus_56752_iso_2/34-81    (37)
      |              |              |                     /--100--+                   
      |              |              |                     |       |------- cra_locus_10685_iso_4/154-201  (52)
      |              |              |                     |       |                   
      |              |              |              /--82--+       \------- cra_locus_69016_iso_1/58-105   (86)
      |              |              |              |      |                           
      |              |              |              |      \--------------- cra_locus_15559_iso_6/381-428  (56)
      |              |      /---88--+              |                                  
      |              |      |       |              |---------------------- cra_locus_3361_iso_5/378-426   (23)
      |              |      |       |              |                                  
      |              |      |       |      /---65--+              /------- cra_locus_10414_iso_2/261-308  (27)
      |              |      |       |      |       |      /---76--+                   
      |              |      |       |      |       |      |       \------- cra_locus_12175_iso_3/230-270  (79)
      |              |      |       |      |       |--51--+                           
      |              |      |       |--100-+       |      \--------------- cra_locus_23695_iso_1/150-197  (49)
      |              |      |       |      |       |                                  
      |              |      |       |      |       \---------------------- cra_locus_7979_iso_3/347-394   (74)
      |              |      |       |      |                                          
      +              |      |       |      \------------------------------ cra_locus_625_iso_6/296-344    (46)
      |              |      |       |                                                 
      |              |      |       \------------------------------------- cra_locus_15469_iso_10/229-274 (20)
      |              |      |                                                         
      |              |      |                                     /------- cra_locus_11745_iso_2/250-288  (21)
      |              |      |                             /---97--+                   
      |              |      |                             |       \------- cra_locus_6803_iso_6/244-282   (62)
      |              |      |                      /--91--+                           
      |      /---57--+      |                      |      \--------------- cra_locus_16124_iso_1/343-381  (64)
      |      |       |      |                      |                                  
      |      |       |      |       /------100-----+---------------------- cra_locus_13647_iso_1/133-171  (47)
      |      |       |      |       |              |                                  
      |      |       |      |       |              \---------------------- cra_locus_13883_iso_3/318-355  (58)
      |      |       |--63--+       |                                                 
      |      |       |      |---51--+      /------------------------------ cra_locus_5787_iso_1/225-270   (36)
      |      |       |      |       |      |                                          
      |      |       |      |       |      |                      /------- cra_locus_55803_iso_1/47-92    (54)
      |      |       |      |       |      |              /--100--+                   
      |      |       |      |       \--100-+              |       \------- cra_locus_4348_iso_6/385-430   (55)
      |      |       |      |              |       /--72--+                           
      |      |       |      |              |       |      |       /------- cra_locus_12077_iso_2/292-317  (87)
      |      |       |      |              |       |      \---99--+                   
      |      |       |      |              \--100--+              \------- cra_locus_14860_iso_3/319-376  (89)
      |      |       |      |                      |                                  
      |      |       |      |                      \---------------------- cra_locus_4179_iso_4/338-383   (68)
      |      |       |      |                                                         
      |      |       |      |                      /---------------------- cra_locus_9526_iso_1/456-502   (28)
      |      |       |      |                      |                                  
      |      |       |      |                      |              /------- cra_locus_15967_iso_2/150-196  (32)
      |      |       |      |                      |      /--100--+                   
      |      |       |      |                      |      |       \------- cra_locus_7620_iso_3/141-187   (44)
      |--55--+       |      |                      |--82--+                           
      |      |       |      |              /---59--+      |       /------- cra_locus_23016_iso_2/254-299  (61)
      |      |       |      |              |       |      \---92--+                   
      |      |       |      |              |       |              \------- cra_locus_16909_iso_1/272-317  (81)
      |      |       |      |              |       |                                  
      |      |       |      \------68------+       |---------------------- cra_locus_8171_iso_5/474-520   (60)
      |      |       |                     |       |                                  
      |      |       |                     |       \---------------------- cra_locus_12315_iso_1/328-374  (95)
      |      |       |                     |                                          
      |      |       |                     \------------------------------ cra_locus_13213_iso_1/5-47     (63)
      |      |       |                                                                
      |      |       |                                            /------- cra_locus_12955_iso_2/262-311  (39)
      |      |       |                                    /---66--+                   
      |      |       |                                    |       \------- cra_locus_6981_iso_6/46-95     (45)
      |      |       \-----------------100----------------+                           
      |      |                                            \--------------- cra_locus_1884_iso_1/44-93     (57)
      |      |                                                                        
      |      |                                            /--------------- cra_locus_13466_iso_1/80-126   (8)
      |      |                                            |                           
      |      |                                     /--59--+       /------- cra_locus_8055_iso_4/76-122    (10)
      |      |                                     |      \---51--+                   
      |      |                                     |              \------- cra_locus_10934_iso_1/61-107   (66)
      |      \-----------------100-----------------+                                  
      |                                            |              /------- cra_locus_30340_iso_1/14-60    (78)
      |                                            \------90------+                   
      |                                                           \------- cra_locus_751_iso_1/118-164    (85)
      |                                                                               
      |                                                           /------- cra_locus_38360_iso_2/95-146   (3)
      |                                                   /---94--+                   
      |                                                   |       \------- cra_locus_15250_iso_1/115-166  (75)
      |                                            /--95--+                           
      |                                            |      \--------------- cra_locus_25847_iso_1/27-78    (80)
      |                                    /---58--+                                  
      |                                    |       \---------------------- cra_locus_1670_iso_1/111-162   (84)
      |                             /--91--+                                          
      |                             |      \------------------------------ cra_locus_39137_iso_2/200-251  (41)
      |                     /--100--+                                                 
      |                     |       \------------------------------------- cra_locus_28230_iso_1/6-57     (76)
      |                     |                                                         
      |                     |--------------------------------------------- cra_locus_14634_iso_1/56-98    (14)
      |                     |                                                         
      |                     |                      /---------------------- cra_locus_15329_iso_1/274-341  (15)
      |                     |                      |                                  
      |                     |                      |      /--------------- cra_locus_10503_iso_4/441-483  (38)
      |----------51---------+----------57----------+      |                           
      |                     |                      |      |--------------- cra_locus_3368_iso_3/386-428   (43)
      |                     |                      \--99--+                           
      |                     |                             |       /------- cra_locus_18737_iso_1/171-196  (90)
      |                     |                             \--100--+                   
      |                     |                                     \------- cra_locus_7726_iso_6/196-239   (91)
      |                     |                                                         
      |                     |                                     /------- cra_locus_22694_iso_1/306-330  (22)
      |                     \------------------90-----------------+                   
      |                                                           \------- cra_locus_17763_iso_1/131-174  (73)
      |                                                                               
      |                                            /---------------------- cra_locus_17864_iso_1/30-76    (18)
      |                                            |                                  
      |                                            |      /--------------- cra_locus_16831_iso_1/93-143   (34)
      |                                    /---89--+      |                           
      |                                    |       |      |--------------- cra_locus_11812_iso_1/82-134   (53)
      |                                    |       \--100-+                           
      |                                    |              |       /------- cra_locus_58430_iso_1/19-71    (67)
      \-----------------51-----------------+              \---63--+                   
                                           |                      \------- cra_locus_9820_iso_1/30-82     (88)
                                           |                                          
                                           \------------------------------ cra_locus_29303_iso_1/20-60    (31)
                                                                                      

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      /------------------------------------------------------------------- cra_locus_56752_iso_2  (1)
      |                                                                               
      |------------------------------------------------------------------- cra_locus_10685_iso_4  (13)
      |                                                                               
      |                                                           /------- cra_locus_7726_iso_6   (2)
      |                                                   /---76--+                   
      |                                                   |       \------- cra_locus_18737_iso_1  (37)
      |                                            /--100-+                           
      |                                            |      |       /------- cra_locus_3368_iso_3   (33)
      |                                            |      \---98--+                   
      |                                            |              \------- cra_locus_10503_iso_4  (41)
      |                                            |                                  
      |                                            |              /------- cra_locus_15329_iso_1  (20)
      |                     /----------86----------+------72------+                   
      |                     |                      |              \------- cra_locus_22694_iso_1  (82)
      |                     |                      |                                  
      |                     |                      |---------------------- cra_locus_14634_iso_1  (44)
      |                     |                      |                                  
      |                     |                      \---------------------- cra_locus_17763_iso_1  (93)
      |                     |                                                         
      |                     |                                     /------- cra_locus_16831_iso_1  (3)
      |                     |                                     |                   
      |                     |                             /---59--+------- cra_locus_11812_iso_1  (12)
      |                     |                             |       |                   
      |                     |--------------97-------------+       \------- cra_locus_58430_iso_1  (46)
      |                     |                             |                           
      |                     |                             \--------------- cra_locus_9820_iso_1   (45)
      |                     |                                                         
      |                     |                             /--------------- cra_locus_13213_iso_1  (4)
      |                     |                             |                           
      |                     |                             |--------------- cra_locus_9526_iso_1   (7)
      |                     |                             |                           
      |                     |                             |       /------- cra_locus_7620_iso_3   (49)
      |                     |                             |--100--+                   
      |                     |                             |       \------- cra_locus_15967_iso_2  (72)
      |                     |--------------72-------------+                           
      |                     |                             |--------------- cra_locus_8171_iso_5   (56)
      |                     |                             |                           
      |                     |                             |--------------- cra_locus_12315_iso_1  (60)
      |                     |                             |                           
      |                     |                             |       /------- cra_locus_16909_iso_1  (70)
      |                     |                             \--100--+                   
      |                     |                                     \------- cra_locus_23016_iso_2  (75)
      |                     |                                                         
      |                     |--------------------------------------------- cra_locus_29303_iso_1  (5)
      |                     |                                                         
      |                     |                             /--------------- cra_locus_25027_iso_1  (6)
      |                     |                             |                           
      |                     |                      /--78--+       /------- cra_locus_31527_iso_2  (42)
      |                     |                      |      \--100--+                   
      |                     |              /---77--+              \------- cra_locus_40960_iso_1  (91)
      |                     |              |       |                                  
      |                     |       /--74--+       \---------------------- cra_locus_16649_iso_1  (39)
      |                     |       |      |                                          
      |                     |       |      \------------------------------ cra_locus_18990_iso_1  (57)
      |                     |---58--+                                                 
      |                     |       |------------------------------------- cra_locus_7653_iso_2   (27)
      |                     |       |                                                 
      |                     |       \------------------------------------- cra_locus_12546_iso_1  (68)
      |                     |                                                         
      |                     |                                     /------- cra_locus_4594_iso_1   (8)
      |                     |                             /--100--+                   
      |                     |                             |       \------- cra_locus_9367_iso_3   (51)
      |                     |--------------97-------------+                           
      |                     |                             |       /------- cra_locus_3040_iso_1   (14)
      |                     |                             \--100--+                   
      |                     |                                     \------- cra_locus_8576_iso_1   (86)
      |                     |                                                         
      |                     |                                     /------- cra_locus_59466_iso_1  (9)
      |                     |                                     |                   
      |                     |                                     |------- cra_locus_58692_iso_1  (24)
      |                     |------------------50-----------------+                   
      |                     |                                     |------- cra_locus_1344_iso_6   (48)
      |                     |                                     |                   
      |                     |                                     \------- cra_locus_74591_iso_1  (78)
      |                     |                                                         
      |                     |       /------------------------------------- cra_locus_1467_iso_1   (10)
      |                     |       |                                                 
      |                     |       |                             /------- cra_locus_2845_iso_5   (19)
      |                     |       |                     /--100--+                   
      |                     |       |                     |       \------- cra_locus_12822_iso_1  (34)
      |                     |---97--+              /--100-+                           
      |                     |       |              |      \--------------- cra_locus_1072_iso_2   (71)
      +                     |       |      /---53--+                                  
      |                     |       |      |       \---------------------- cra_locus_19483_iso_1  (36)
      |                     |       \--82--+                                          
      |                     |              \------------------------------ cra_locus_30819_iso_1  (26)
      |                     |                                                         
      |                     |                                     /------- cra_locus_13466_iso_1  (11)
      |                     |                             /---75--+                   
      |                     |                             |       \------- cra_locus_10934_iso_1  (15)
      |                     |                             |                           
      |                     |--------------76-------------+       /------- cra_locus_8055_iso_4   (66)
      |              /--97--+                             |       |                   
      |              |      |                             \---72--+------- cra_locus_751_iso_1    (67)
      |              |      |                                     |                   
      |              |      |                                     \------- cra_locus_30340_iso_1  (90)
      |              |      |                                                         
      |              |      |                             /--------------- cra_locus_12077_iso_2  (16)
      |              |      |                             |                           
      |              |      |                             |--------------- cra_locus_4179_iso_4   (38)
      |              |      |                             |                           
      |              |      |                      /--98--+       /------- cra_locus_4348_iso_6   (54)
      |              |      |                      |      |--100--+                   
      |              |      |                      |      |       \------- cra_locus_55803_iso_1  (79)
      |              |      |----------93----------+      |                           
      |              |      |                      |      \--------------- cra_locus_14860_iso_3  (74)
      |              |      |                      |                                  
      |              |      |                      \---------------------- cra_locus_5787_iso_1   (50)
      |              |      |                                                         
      |              |      |                                     /------- cra_locus_121939_iso_1 (21)
      |              |      |------------------61-----------------+                   
      |              |      |                                     \------- cra_locus_14847_iso_4  (73)
      |              |      |                                                         
      |              |      |                      /---------------------- cra_locus_1670_iso_1   (22)
      |              |      |                      |                                  
      |              |      |                      |              /------- cra_locus_38360_iso_2  (52)
      |              |      |              /--100--+      /---59--+                   
      |              |      |              |       |      |       \------- cra_locus_15250_iso_1  (87)
      |              |      |              |       \--75--+                           
      |              |      |------100-----+              \--------------- cra_locus_25847_iso_1  (69)
      |              |      |              |                                          
      |              |      |              |                      /------- cra_locus_39137_iso_2  (61)
      |              |      |              \----------88----------+                   
      |              |      |                                     \------- cra_locus_28230_iso_1  (76)
      |              |      |                                                         
      |              |      |                                     /------- cra_locus_4107_iso_2   (23)
      |              |      |                             /---68--+                   
      |              |      |                             |       \------- cra_locus_57960_iso_1  (47)
      |              |      |                      /--72--+                           
      |              |      |                      |      \--------------- cra_locus_7910_iso_2   (35)
      |              |      |----------79----------+                                  
      |              |      |                      \---------------------- cra_locus_15469_iso_10 (96)
      |              |      |                                                         
      |              |      |                                     /------- cra_locus_5660_iso_3   (25)
      |              |      |------------------64-----------------+                   
      |              |      |                                     \------- cra_locus_4548_iso_5   (40)
      |              |      |                                                         
      |              |      |                                     /------- cra_locus_941_iso_5    (29)
      |              |      |------------------82-----------------+                   
      |      /--100--+      |                                     \------- cra_locus_104520_iso_1 (32)
      |      |       |      |                                                         
      |      |       |      |--------------------------------------------- cra_locus_10223_iso_4  (30)
      |      |       |      |                                                         
      |      |       |      |--------------------------------------------- cra_locus_83174_iso_1  (43)
      |      |       |      |                                                         
      |      |       |      |                                     /------- cra_locus_13883_iso_3  (55)
      |      |       |      |                      /------96------+                   
      |      |       |      |                      |              \------- cra_locus_13647_iso_1  (80)
      |      |       |      |                      |                                  
      |      |       |      |----------100---------+      /--------------- cra_locus_16124_iso_1  (65)
      |      |       |      |                      |      |                           
      |      |       |      |                      \--97--+       /------- cra_locus_6803_iso_6   (85)
      |      |       |      |                             \--100--+                   
      |      |       |      |                                     \------- cra_locus_11745_iso_2  (92)
      |      |       |      |                                                         
      |      |       |      |--------------------------------------------- cra_locus_5400_iso_2   (63)
      |      |       |      |                                                         
      |      |       |      |                             /--------------- cra_locus_12955_iso_2  (64)
      |      |       |      |                             |                           
      |      |       |      |-------------100-------------+       /------- cra_locus_1884_iso_1   (81)
      |      |       |      |                             \---55--+                   
      |      |       |      |                                     \------- cra_locus_6981_iso_6   (84)
      |      |       |      |                                                         
      |      |       |      |--------------------------------------------- cra_locus_113547_iso_1 (77)
      \--52--+       |      |                                                         
             |       |      |--------------------------------------------- cra_locus_17864_iso_1  (83)
             |       |      |                                                         
             |       |      |                                     /------- cra_locus_16044_iso_1  (89)
             |       |      |------------------95-----------------+                   
             |       |      |                                     \------- cra_locus_10082_iso_3  (94)
             |       |      |                                                         
             |       |      \--------------------------------------------- cra_locus_12774_iso_1  (95)
             |       |                                                                
             |       |---------------------------------------------------- cra_locus_23695_iso_1  (17)
             |       |                                                                
             |       |                                            /------- cra_locus_7979_iso_3   (18)
             |       |                                    /--100--+                   
             |       |                                    |       \------- cra_locus_15559_iso_6  (62)
             |       |-----------------64-----------------+                           
             |       |                                    \--------------- cra_locus_3361_iso_5   (58)
             |       |                                                                
             |       |                                            /------- cra_locus_12175_iso_3  (28)
             |       |---------------------99---------------------+                   
             |       |                                            \------- cra_locus_10414_iso_2  (53)
             |       |                                                                
             |       \---------------------------------------------------- cra_locus_625_iso_6    (59)
             |                                                                        
             |                                                    /------- cra_locus_69016_iso_1  (31)
             \-------------------------99-------------------------+                   
                                                                  \------- cra_locus_11711_iso_2  (88)