PlantTFDB
PlantRegMap/PlantTFDB v5.0
Plant Transcription Factor Database
Phylogenetic Tree for
Catharanthus roseus
HD-ZIP Family
Phylogenetic tree for domain ? help Back to Top

      /------------------------------------------------------------------- cra_locus_15637_iso_2/26-83   (1)
      |                                                                               
      |------------------------------------------------------------------- cra_locus_4916_iso_4/5-63     (18)
      |                                                                               
      |                                               /------------------- cra_locus_3991_iso_1/120-174  (2)
      |                                               |                               
      |                                               |        /---------- cra_locus_16080_iso_1/233-285 (9)
      |                                     /----76---+        |                      
      |                                     |         |        |---------- cra_locus_7817_iso_2/164-218  (11)
      |                                     |         \---97---+                      
      |                                     |                  |---------- cra_locus_1081_iso_4/133-187  (14)
      |                            /---100--+                  |                      
      |                            |        |                  \---------- cra_locus_30222_iso_2/3-38    (28)
      |                            |        |                                         
      |                            |        \----------------------------- cra_locus_6945_iso_1/149-203  (6)
      |                            |                                                  
      |                            |                           /---------- cra_locus_3299_iso_2/43-93    (3)
      |                            |                           |                      
      |                            |                           |---------- cra_locus_8916_iso_2/44-96    (15)
      |                            |        /--------100-------+                      
      |                            |        |                  |---------- cra_locus_64452_iso_1/8-62    (21)
      |                            |        |                  |                      
      |                  /---100---+        |                  \---------- cra_locus_4276_iso_2/31-85    (23)
      +                  |         |        |                                         
      |                  |         |        |                  /---------- cra_locus_11227_iso_5/75-129  (5)
      |                  |         |        |         /---99---+                      
      |                  |         |        |         |        \---------- cra_locus_68351_iso_1/39-92   (24)
      |                  |         |        |----98---+                               
      |                  |         |        |         \------------------- cra_locus_22954_iso_1/73-125  (7)
      |                  |         |        |                                         
      |                  |         |        |----------------------------- cra_locus_1901_iso_1/80-133   (8)
      |                  |         |        |                                         
      |                  |         \---99---+----------------------------- cra_locus_30366_iso_1/3-57    (12)
      |                  |                  |                                         
      |                  |                  |                  /---------- cra_locus_507_iso_2/58-111    (16)
      |         /---100--+                  |--------51--------+                      
      |         |        |                  |                  \---------- cra_locus_3849_iso_4/44-96    (26)
      |         |        |                  |                                         
      |         |        |                  |----------------------------- cra_locus_1635_iso_3/92-145   (19)
      |         |        |                  |                                         
      |         |        |                  |----------------------------- cra_locus_23063_iso_1/12-66   (20)
      |         |        |                  |                                         
      |         |        |                  |----------------------------- cra_locus_12433_iso_1/54-106  (22)
      |         |        |                  |                                         
      |         |        |                  \----------------------------- cra_locus_76899_iso_1/38-91   (25)
      \----74---+        |                                                            
                |        |                            /------------------- cra_locus_2496_iso_3/108-163  (4)
                |        |                            |                               
                |        \-------------100------------+        /---------- cra_locus_5262_iso_1/53-108   (10)
                |                                     |        |                      
                |                                     \---89---+---------- cra_locus_41952_iso_1/126-181 (13)
                |                                              |                      
                |                                              \---------- cra_locus_14361_iso_3/84-139  (29)
                |                                                                     
                |                                              /---------- cra_locus_5090_iso_8/20-78    (17)
                \----------------------59----------------------+                      
                                                               \---------- cra_locus_1920_iso_4/20-78    (27)
                                                                                      

Phylogenetic tree for protein ? help Back to Top

      /------------------------------------------------------------------- cra_locus_4916_iso_4  (1)
      |                                                                               
      |------------------------------------------------------------------- cra_locus_15637_iso_2 (13)
      |                                                                               
      |                                                     /------------- cra_locus_41952_iso_1 (2)
      |                                                     |                         
      |                                              /--100-+     /------- cra_locus_14361_iso_3 (4)
      |                                              |      \-100-+                   
      |            /---------------100---------------+            \------- cra_locus_5262_iso_1  (5)
      |            |                                 |                                
      |            |                                 \-------------------- cra_locus_2496_iso_3  (29)
      |            |                                                                  
      |            |                                              /------- cra_locus_12433_iso_1 (3)
      |            |                                        /--99-+                   
      |            |                                        |     \------- cra_locus_23063_iso_1 (27)
      |            |                                 /--51--+                         
      |            |                                 |      |     /------- cra_locus_507_iso_2   (11)
      |            |                                 |      \--65-+                   
      |            |                          /--58--+            \------- cra_locus_76899_iso_1 (16)
      |            |                          |      |                                
      +            |                          |      |            /------- cra_locus_1635_iso_3  (10)
      |            |                          |      \-----96-----+                   
      |            |                          |                   \------- cra_locus_1901_iso_1  (17)
      |            |                          |                                       
      |            |                    /--99-+                   /------- cra_locus_64452_iso_1 (7)
      |      /-100-+                    |     |                   |                   
      |      |     |                    |     |             /--85-+------- cra_locus_4276_iso_2  (12)
      |      |     |                    |     |             |     |                   
      |      |     |                    |     |      /--100-+     \------- cra_locus_3299_iso_2  (15)
      |      |     |                    |     |      |      |                         
      |      |     |             /--78--+     \--83--+      \------------- cra_locus_8916_iso_2  (19)
      |      |     |             |      |            |                                
      |      |     |             |      |            \-------------------- cra_locus_3849_iso_4  (18)
      |      |     |             |      |                                             
      |      |     |             |      |                   /------------- cra_locus_22954_iso_1 (8)
      |      |     |      /--100-+      |                   |                         
      |      |     |      |      |      \--------100--------+     /------- cra_locus_11227_iso_5 (23)
      |      |     |      |      |                          \--87-+                   
      |      |     |      |      |                                \------- cra_locus_68351_iso_1 (24)
      |      |     |      |      |                                                    
      \--100-+     |      |      \---------------------------------------- cra_locus_30366_iso_1 (21)
             |     |      |                                                           
             |     \--100-+                                       /------- cra_locus_16080_iso_1 (6)
             |            |                                 /--56-+                   
             |            |                                 |     \------- cra_locus_30222_iso_2 (22)
             |            |                          /--58--+                         
             |            |                          |      |     /------- cra_locus_1081_iso_4  (9)
             |            |                          |      \--98-+                   
             |            \------------100-----------+            \------- cra_locus_7817_iso_2  (28)
             |                                       |                                
             |                                       |            /------- cra_locus_3991_iso_1  (14)
             |                                       \-----100----+                   
             |                                                    \------- cra_locus_6945_iso_1  (25)
             |                                                                        
             |                                                    /------- cra_locus_5090_iso_8  (20)
             \-------------------------98-------------------------+                   
                                                                  \------- cra_locus_1920_iso_4  (26)