PlantRegMap/PlantTFDB v5.0
Plant Transcription
Factor Database
|
Home TFext BLAST Prediction Download Help About Links PlantRegMap |
Phylogenetic Tree for
Catharanthus roseus
C2H2 FamilyPhylogenetic tree for domain ? help Back to Top |
---|
/------------------------------------------------------------------- cra_locus_384_iso_1/107-128 (1) | |------------------------------------------------------------------- cra_locus_7801_iso_1/662-684 (7) | |------------------------------------------------------------------- cra_locus_24253_iso_3/142-164 (8) | |------------------------------------------------------------------- cra_locus_7801_iso_1/720-746 (9) | |------------------------------------------------------------------- cra_locus_6393_iso_8/99-121 (14) | |------------------------------------------------------------------- cra_locus_384_iso_1/275-299 (21) | |------------------------------------------------------------------- cra_locus_88601_iso_1/34-56 (26) | |------------------------------------------------------------------- cra_locus_384_iso_1/236-261 (28) | |------------------------------------------------------------------- cra_locus_1643_iso_1/76-98 (31) | |------------------------------------------------------------------- cra_locus_15544_iso_1/42-64 (33) | |------------------------------------------------------------------- cra_locus_4762_iso_2/135-159 (36) | |------------------------------------------------------------------- cra_locus_16795_iso_1/182-204 (40) | |------------------------------------------------------------------- cra_locus_68728_iso_1/44-67 (59) | |------------------------------------------------------------------- cra_locus_384_iso_1/366-390 (61) | |------------------------------------------------------------------- cra_locus_48041_iso_1/60-82 (64) | |------------------------------------------------------------------- cra_locus_5375_iso_4/104-127 (83) | | /---------------------- cra_locus_2816_iso_1/96-118 (22) | | | |---------------------- cra_locus_14421_iso_1/96-118 (35) | | | |---------------------- cra_locus_36623_iso_1/2-24 (56) |---------------------96---------------------+ | | /----------- cra_locus_763_iso_5/99-121 (71) | |----61----+ | | \----------- cra_locus_6529_iso_1/108-130 (84) | | | \---------------------- cra_locus_4591_iso_2/96-118 (82) | | /----------- cra_locus_4762_iso_2/227-252 (48) |---------------------------95--------------------------+ | \----------- cra_locus_4762_iso_2/165-189 (80) | | /----------- cra_locus_33244_iso_1/2-20 (13) |---------------------------91--------------------------+ | \----------- cra_locus_18478_iso_1/241-256 (69) | | /----------- cra_locus_13469_iso_3/257-279 (6) | /----93----+ | | \----------- cra_locus_7643_iso_2/176-198 (65) | /----66----+ | | \---------------------- cra_locus_49517_iso_1/253-275 (47) | /-----68----+ | | \--------------------------------- cra_locus_17900_iso_2/239-261 (38) | | | | /----------- cra_locus_31727_iso_1/1-23 (19) | | /----76----+ | /----70----+ | \----------- cra_locus_5807_iso_2/198-220 (60) | | | /----98----+ | | | | \---------------------- cra_locus_18200_iso_1/133-155 (39) | | | | | | \----100----+ /----------- cra_locus_9907_iso_1/143-165 (24) | | | | |----90----+ | |----------- cra_locus_25985_iso_4/153-175 (37) | | \----------52---------+ | | |----------- cra_locus_7687_iso_3/138-160 (46) | | | | | \----------- cra_locus_8127_iso_3/152-174 (81) | | | \-------------------------------------------------------- cra_locus_18478_iso_1/209-232 (53) | | /----------- cra_locus_4762_iso_2/105-129 (49) |---------------------------86--------------------------+ | \----------- cra_locus_4762_iso_2/78-100 (54) | | /---------------------- cra_locus_86538_iso_1/4-26 (17) | | | |---------------------- cra_locus_27388_iso_1/153-175 (58) |---------------------82---------------------+ | | /----------- cra_locus_22971_iso_1/96-117 (73) | \----98----+ + \----------- cra_locus_7006_iso_1/63-85 (76) | | /---------------------- cra_locus_10725_iso_2/121-146 (18) | | |---------------------76---------------------+ /----------- cra_locus_8669_iso_4/235-257 (55) | \----60----+ | \----------- cra_locus_8669_iso_4/269-291 (75) | | /----------- cra_locus_21851_iso_1/265-287 (5) | /----82----+ | | \----------- cra_locus_29143_iso_1/31-53 (29) |---------------------71---------------------+ | \---------------------- cra_locus_24253_iso_3/183-205 (43) | | /----------- cra_locus_88291_iso_1/64-83 (3) | | |---------------------------70--------------------------+----------- cra_locus_15325_iso_1/47-69 (44) | | | \----------- cra_locus_16006_iso_1/42-64 (79) | | /----------- cra_locus_20995_iso_1/129-149 (12) |---------------------------70--------------------------+ | \----------- cra_locus_21851_iso_1/4-26 (34) | | /--------------------------------------------- cra_locus_21851_iso_1/212-234 (27) | | | |--------------------------------------------- cra_locus_16795_iso_1/118-140 (30) | | | | /---------------------- cra_locus_94135_iso_1/85-107 (51) | | | | | /----59----+ /----------- cra_locus_22971_iso_1/50-72 (62) |----------61---------+ | \----79----+ | |-----78----+ \----------- cra_locus_17488_iso_1/33-55 (66) | | | | | \--------------------------------- cra_locus_27388_iso_1/85-107 (52) | | | |--------------------------------------------- cra_locus_60730_iso_1/13-35 (63) | | | \--------------------------------------------- cra_locus_20995_iso_1/386-408 (77) | | /----------- cra_locus_16537_iso_1/201-224 (10) |---------------------------60--------------------------+ | \----------- cra_locus_13048_iso_1/133-156 (42) | | /----------- cra_locus_7643_iso_2/92-111 (2) | /----96----+ | | \----------- cra_locus_13469_iso_3/173-192 (45) | /----74----+ | | \---------------------- cra_locus_17900_iso_2/155-174 (85) | /-----89----+ | | \--------------------------------- cra_locus_49517_iso_1/169-188 (87) | | | | /----------- cra_locus_3304_iso_3/70-92 (4) | | | | | |----------- cra_locus_7687_iso_3/59-81 (20) | | | | | |----------- cra_locus_25985_iso_4/77-99 (23) | | | | | |----------- cra_locus_6447_iso_4/67-89 (32) | | /----56----+ | | | |----------- cra_locus_22981_iso_2/79-101 (57) | | | | |----------60---------+ | |----------- cra_locus_8127_iso_3/76-98 (67) | | | | | |----------79----------+ |----------- cra_locus_21420_iso_1/73-91 (78) | | | | | | | \----------- cra_locus_9907_iso_1/67-89 (86) | | | | | | /----------- cra_locus_18200_iso_1/55-77 (16) | | \----89----+ | | \----------- cra_locus_5807_iso_2/114-136 (50) | | | | /----------- cra_locus_19661_iso_1/164-185 (25) | | | | \----------------62---------------+----------- cra_locus_18478_iso_1/123-145 (70) | | | \----------- cra_locus_1271_iso_1/270-291 (72) | | /----------- cra_locus_5592_iso_1/157-180 (15) | /----59----+ | | \----------- cra_locus_45433_iso_1/33-55 (41) |---------------------56---------------------+ | \---------------------- cra_locus_13570_iso_1/78-100 (74) | | /----------- cra_locus_6296_iso_3/416-438 (11) \---------------------------53--------------------------+ \----------- cra_locus_3791_iso_2/240-262 (68) |
Phylogenetic tree for protein ? help Back to Top |
---|
/------------------------------------------------------------------- cra_locus_86538_iso_1 (1) | |------------------------------------------------------------------- cra_locus_36623_iso_1 (14) | |------------------------------------------------------------------- cra_locus_10725_iso_2 (28) | |------------------------------------------------------------------- cra_locus_24253_iso_3 (36) | |------------------------------------------------------------------- cra_locus_29143_iso_1 (42) | |------------------------------------------------------------------- cra_locus_60730_iso_1 (53) | | /------- cra_locus_21851_iso_1 (41) |-----------------------------97----------------------------+ | \------- cra_locus_20995_iso_1 (58) | | /------- cra_locus_2816_iso_1 (3) | /---95--+ | | \------- cra_locus_14421_iso_1 (35) | /--100-+ | | \--------------- cra_locus_4591_iso_2 (21) |---------------------91---------------------+ | \---------------------- cra_locus_6529_iso_1 (5) | | /------- cra_locus_13048_iso_1 (4) | /-------------100-------------+ | | \------- cra_locus_16537_iso_1 (17) | | | | /--------------- cra_locus_3791_iso_2 (15) | | | | /---92--+ /--83--+ /------- cra_locus_13570_iso_1 (40) | | | | \---80--+ | | | /---93--+ \------- cra_locus_45433_iso_1 (57) | | | | | | | \--97--+ \---------------------- cra_locus_5592_iso_1 (44) | | | | /--52--+ \------------------------------ cra_locus_5375_iso_4 (59) | | | | | | /------- cra_locus_17900_iso_2 (10) | | | | | | | /---51--+------- cra_locus_13469_iso_3 (27) | | | | | | | \--------------93-------------+ \------- cra_locus_7643_iso_2 (30) | | | | | \--------------- cra_locus_49517_iso_1 (51) | | | /---62--+ /------- cra_locus_19661_iso_1 (7) | | | /---53--+ | | | | \------- cra_locus_1271_iso_1 (22) | | | /-------------100-------------+ | | | | \--------------- cra_locus_18478_iso_1 (19) | | | | | | | | /--------------- cra_locus_18200_iso_1 (8) | | | | | | | | | /--100-+ /------- cra_locus_5807_iso_2 (34) | | | | | \--100--+ | | \--93--+ /------68------+ \------- cra_locus_31727_iso_1 (45) | | | | | + | | | \---------------------- cra_locus_22981_iso_2 (48) | | | | | | | | /------- cra_locus_3304_iso_3 (18) | | | | /--100--+ | | | | | \------- cra_locus_8127_iso_3 (49) | | \---98--+ /--84--+ | | | | | /------- cra_locus_21420_iso_1 (33) | | | | \---83--+ |--78--+ | /---91--+ \------- cra_locus_25985_iso_4 (47) | | | | | | | | | \---------------------- cra_locus_7687_iso_3 (54) | | | | | | \--52--+ /------- cra_locus_9907_iso_1 (37) | | | /---89--+ | | | | \------- cra_locus_6447_iso_4 (52) | | \------78------+ | | \--------------- cra_locus_33244_iso_1 (46) | | | |------------------------------------------------------------ cra_locus_8669_iso_4 (11) | | | |------------------------------------------------------------ cra_locus_384_iso_1 (20) | | | |------------------------------------------------------------ cra_locus_68728_iso_1 (31) | | | |------------------------------------------------------------ cra_locus_7801_iso_1 (38) | | | |------------------------------------------------------------ cra_locus_6393_iso_8 (39) | | | \------------------------------------------------------------ cra_locus_4762_iso_2 (43) | | /------------------------------ cra_locus_27388_iso_1 (6) | | | | /--------------- cra_locus_17488_iso_1 (9) | /--99--+ | | | | /--76--+ /------- cra_locus_22971_iso_1 (50) | | | | \--100--+ | | \---82--+ \------- cra_locus_7006_iso_1 (56) |--------------76-------------+ | | | \---------------------- cra_locus_94135_iso_1 (26) | | | \------------------------------------- cra_locus_16795_iso_1 (29) | | /---------------------- cra_locus_88601_iso_1 (2) | | | | /------- cra_locus_15325_iso_1 (13) | | /---93--+ | | | \------- cra_locus_88291_iso_1 (55) |---------------------76---------------------+--95--+ | | \--------------- cra_locus_16006_iso_1 (24) | | | |---------------------- cra_locus_6296_iso_3 (23) | | | \---------------------- cra_locus_15544_iso_1 (32) | | /------- cra_locus_1643_iso_1 (12) | /--100--+ | | \------- cra_locus_48041_iso_1 (25) \-------------------------50------------------------+ \--------------- cra_locus_763_iso_5 (16) |