PlantTFDB
PlantRegMap/PlantTFDB v5.0
Plant Transcription Factor Database
Home  TFext  BLAST  Prediction  Download  Help  About  Links  PlantRegMap
(e.g., LFY)
Transcription Factor Information
Basic Information | Signature Domain | Sequence | 
Basic Information? help Back to Top
TF ID GBG84612.1
Organism
Chara braunii
Taxonomic ID
Taxonomic Lineage
cellular organisms; Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Streptophytina; Charophyceae; Charales; Characeae; Chara
Family G2-like
Protein Properties Length: 2731aa    MW: 303789 Da    PI: 6.344
Description G2-like family protein
Gene Model
Gene Model ID Type Source Coding Sequence
GBG84612.1genomeNCBIView CDS
Signature Domain? help Back to Top
Signature Domain
No. Domain Score E-value Start End HMM Start HMM End
1G2-like279.9e-0921352160127
     G2-like    1 kprlrWtpeLHerFveaveqLGGsekA 27  
                  kprl+Wt eLH+rF++av++L G ++A
  GBG84612.1 2135 KPRLVWTAELHSRFMNAVNHL-GVKNA 2160
                  79*******************.66666 PP
Sequence ? help Back to Top
Protein Sequence    Length: 2731 aa     Download sequence    
MSCPKDSCAP LASHVEDVGT PTSDMSSIFH RSDKTHRSGE VALTIVGVVV AKREEMRLES  60
TMASAEGLRL EADAWLSRLH DGREILRAMA SILFPQPLSG LEVDCGATLV VRWVKEILQR  120
MQEVVEPFEQ GAEVELDTYI DWQQAQTLWH DCLHLLAEGR ARGAVLINLG KDGTESSQLP  180
STTVSTTTST MTATSPVTAA SKAMSTSSMT TTNTISIDKD VAAVPGIDDD INKDSGDIYC  240
NIDTNDIIFD TKRMITSSMT IANSIIIDKD VTAVPGIIDD INKDSGGIHR NTEKNDIIFN  300
TIDQDGNAVP FTKHDHKNDC GSIFYNNIII STGILKDDWA KEADGDVERL SCTLQEGKME  360
ESETKIALLL SHFTDLLATC IAQQENIHSL DAEVKSVRSR VQQLEQRPAA APVASSSNTL  420
DRLDALETDA STLKDGARLQ QTATQQLEQR VCATATSLSS GQRESTPKFD GQEIFCDSTK  480
TDPVQWFRKF ELTLQLHLVS ECKHHAYLYY LSGGACQTWL DNLLSQYGLV AAELHTKINW  540
EDLKVAWHKR FQVEPPEIKA MDKLMTFEQG SLPSVDWIAK YQRLTSVPSL PMGFKAIKHC  600
FISRSCPTLS NALTHDYVAR LVPALGSFAQ GQDVCATSSP SGNGSSSSSS ESSRDLARGF  660
NIEELDPLKS GDFAWLPLPT TGRLPGPQCA ALCAHLHKYL SFYAPPTSPT DDEVAVGDIL  720
TYVTKVAREF RTQRYDDNNA PLMYVHIQVG QASCSALLDS GATRNFMSQT FMQRAGLGAQ  780
VRRKANPTAI KLADGKTQQL LDRYTEAVPV YFAPHACEPV TFDILDTDFD IILGMPWLAS  840
ADHTFADIFE SPTGVVPDRP ISHEIILEAS AVPPKGCIYR MSEEDLEVLR AQLDDLLAKG  900
WIRPSSSPYG APVLFVRKKN KDLRLCIDYR KLNAQTVKNA GPLSRIDDLL ERLGGAKFFS  960
KLDLKSGYYQ ISIRPNDCYK TAFKMRYGHF EWVVMPFGLT NSRATFQAAM THEFLAMLDR  1020
FVLVYLDDIL AYNRTLEDHL EHLRCVLEML RRAKYQANRD KCEFVRQELE YLGHFVTPKG  1080
ISPLSEKIQA IQEWPEPRNV TDVRSFLGLA GYYQCFIKGY SKIAAHLTKL QCEDRSFDFD  1140
EDARSSFLAL KAALLSAEVL RIYDPLLPTR VTTDASDYGI GAVLEQHDGV DWHPVEYFNK  1200
KVPAVHSIDD ARKKELLAFV HALKRWRHFL LGRRQFRWVT DNNPLVFYKT QDTINSTIAR  1260
WTAFIDQFDF FPDHIPGKSN RFADALSRRP DHCTTVYSTF EIDNDLRDNF IRGYQADPEF  1320
RDKYANCSLP NPAPSHYRIQ EGYLLVHSRG KDLLCVPSDP HLRTRLLGEF HDASATGHFG  1380
VNRTIGRLRE RFWWPGLLDD VTRYCESCEI CRRCKSRNHR PYGELRPLPV PLRRREAIAM  1440
DITGPFPNHK TGVDGILTVV NRLTKFAMFL PCRYHAKASE LAEILYAARH PQTDGQTERA  1500
HQTAQVLLRT LIRPDQKDWV ERLPDVELAY NSSIHPAIGM SPFEFEHGSP VTSLLDTTVP  1560
RTAESDDHLL FLRRMQELLV KVRNQMEKTQ QRMSQQANRQ RLPCPFRVGD LVWVSAAEFS  1620
VEQDISRKLL LKLMGPWPIV APAGDAPEGP SFTVQVPAHL PVYPVFHCSK LTLYTPADQD  1680
DFPGRRSQDP PSMDGFQEAN NNNNNNNNNN NNNNNNNNKE KKKKKKKEKK KEKKEKKKKK  1740
KKKKKKKKKK KKKMKKKKKK EEEEEEDEEE DEEDEEEEDK EDDDEEEEED EEDEEEEEEE  1800
EEEEEEEEEE EGDDADNRMA HIGLLDYLSA SPIQVVDALP DWYWDVIAEM VAACPPMVET  1860
VNAFPSLLQI DWPHSLHLTR GVVKKMIRSS IFKIQPGEEN QITKTDADFA VNLEPDLLLE  1920
DESRDQQLQS TSEETPERSQ HDLVAGAFAS TSGAGDEPVS LVESLSNTHF ASLSSPSSSS  1980
AAGGTVPVSS LALGSLSGVG SPSPVHGSLA YGGHGGGSSH RWPGASAPTD ATAVCASGSG  2040
GATGGTSTSG SRGGGGGTTT GGGDDETLLA GTSGGEATSS GEGTSGVGVA AGGGVTSSAA  2100
SGGAVGTSSS AQGQSSASGS GPGPGSSPSG RSMKKPRLVW TAELHSRFMN AVNHLGVKNA  2160
GKGEASEAKP RIPFDPLEVE LRAQQEKLLQ QVQAVESLKS ELKKKKEATE KEVRRKLLIA  2220
DVEKIRTSDR VTVQRTYLSG FKCDEDVKVS TILARLERTA LEWCTSTSSK QGMEVSDWAQ  2280
RLGVTGFLHA LQDRFVDKEQ ARKAADKILR LGHKKLDGFL SKLYSTFESL TSTPGLEMSE  2340
QDLLIHFLRA APEQFQLPLF SQGHKDWRSF GRAALDLESK LHVQKAHSEG RKGPSSKGHR  2400
RRKGALFAAA ALSSDDDATS QGGTPPSGTA SSSAAYLVLA LVDALMSLTK GKSQAQKAPT  2460
SSKGKGSFTF EDSELDETWE EEDAQCLADL FLSLQEKKKQ RSELILLRPS ILGAKIKGLL  2520
DFGATRNFMS PKAVNKLHLN QRLVKLRQPI EDWSRPANIR DVRSFLGLAS YYRKFIQNFS  2580
SIAAPLTDLT KKDTSFLWTS ECQEAFTCLK ETLIRALVLK LPDPTLPFVL TTDARQYGVG  2640
AVLQQDDGNG LQPIEYMSKK IKTKKLQDST YEKELYALIS ALKHWKHFLL GRYFKIFSEH  2700
STLDFMLHLC SRRTGQPSQF PQQGKQSRRS F
Nucleic Localization Signal ? help Back to Top
NLS
No. Start End Sequence
117211727KKKKKKK
217211731KKKKKKKEKKK
317211739KKKKKKKEKKKEKKEKKKK
417211743KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKK
517211750KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKKKKKKKKK
617211753KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKKKKKKKKKKKK
717211760KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKKKKKKKKKKKKMKKKKKK
817221730KKKKKKEKK
917221732KKKKKKKEKKK
1017221740KKKKKKKEKKKEKKEKKKK
1117221744KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKK
1217221751KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKKKKKKKKK
1317221754KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKKKKKKKKKKKK
1417221761KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKKKKKKKKKKKKMKKKKKK
1517231733KKKKKKKEKKK
1617231741KKKKKKKEKKKEKKEKKKK
1717231745KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKK
1817231752KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKKKKKKKKK
1917231755KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKKKKKKKKKKKK
2017231762KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKKKKKKKKKKKKMKKKKKK
2117241742KKKKKKKEKKKEKKEKKKK
2217241746KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKK
2317241753KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKKKKKKKKK
2417241756KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKKKKKKKKKKKK
2517241763KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKKKKKKKKKKKKMKKKKKK
2617251743KKKKKKKEKKKEKKEKKKK
2717251747KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKK
2817261734KKKKKKEKK
2917261765KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKKKKKKKKKKKKMKKKKKK
3017291751KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKK
3117331741KKKKKKEKK
3217361744KKKKKKEKK
3317361742KKKKKKK
3417361746KKKKKKKEKKK
3517361754KKKKKKKEKKKEKKEKKKK
3617361758KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKK
3717361765KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKKKKKKKKK
3817361760KKKKKKKKKKKKKKKKKKMKKKKKK
3917371745KKKKKKEKK
4017371743KKKKKKK
4117371747KKKKKKKEKKK
4217371755KKKKKKKEKKKEKKEKKKK
4317371759KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKK
4417371766KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKKKKKKKKK
4517371761KKKKKKKKKKKKKKKKKKMKKKKKK
4617381746KKKKKKEKK
4717381744KKKKKKK
4817381748KKKKKKKEKKK
4917381756KKKKKKKEKKKEKKEKKKK
5017381760KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKK
5117381767KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKKKKKKKKK
5217381762KKKKKKKKKKKKKKKKKKMKKKKKK
5317391747KKKKKKEKK
5417391745KKKKKKK
5517391749KKKKKKKEKKK
5617391757KKKKKKKEKKKEKKEKKKK
5717391761KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKK
5817391768KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKKKKKKKKK
5917391763KKKKKKKKKKKKKKKKKKMKKKKKK
6017401748KKKKKKEKK
6117401746KKKKKKK
6217401750KKKKKKKEKKK
6317401758KKKKKKKEKKKEKKEKKKK
6417401762KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKK
6517401769KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKKKKKKKKK
6617401764KKKKKKKKKKKKKKKKKKMKKKKKK
6717411749KKKKKKEKK
6817411747KKKKKKK
6917411751KKKKKKKEKKK
7017411759KKKKKKKEKKKEKKEKKKK
7117411763KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKK
7217411770KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKKKKKKKKK
7317411765KKKKKKKKKKKKKKKKKKMKKKKKK
7417421750KKKKKKEKK
7517421748KKKKKKK
7617421752KKKKKKKEKKK
7717421760KKKKKKKEKKKEKKEKKKK
7817421764KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKK
7917421766KKKKKKKKKKKKKKKKKKMKKKKKK
8017431751KKKKKKEKK
8117431749KKKKKKK
8217431753KKKKKKKEKKK
8317431761KKKKKKKEKKKEKKEKKKK
8417431765KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKK
8517431767KKKKKKKKKKKKKKKKKKMKKKKKK
8617441752KKKKKKEKK
8717441750KKKKKKK
8817441754KKKKKKKEKKK
8917441762KKKKKKKEKKKEKKEKKKK
9017441766KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKK
9117441768KKKKKKKKKKKKKKKKKKMKKKKKK
9217451753KKKKKKEKK
9317451751KKKKKKK
9417451755KKKKKKKEKKK
9517451763KKKKKKKEKKKEKKEKKKK
9617451767KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKK
9717451769KKKKKKKKKKKKKKKKKKMKKKKKK
9817461752KKKKKKK
9917461756KKKKKKKEKKK
10017461764KKKKKKKEKKKEKKEKKKK
10117461768KKKKKKKEKKKEKKEKKKKKKKK
10217461770KKKKKKKKKKKKKKKKKKMKKKKKK
10317471753KKKKKKK
10417471757KKKKKKKEKKK
10517471765KKKKKKKEKKKEKKEKKKK
10617471771KKKKKKKKKKKKKKKKKKMKKKKKK
10717481756KKKKKKEKK
10817481758KKKKKKKEKKK
10917481772KKKKKKKKKKKKKKKKKKMKKKKKK
11017491759KKKKKKKEKKK
11117491773KKKKKKKKKKKKKKKKKKMKKKKKK
11217501774KKKKKKKKKKKKKKKKKKMKKKKKK
11317521760KKKKKKEKK
Best hit in Arabidopsis thaliana ? help Back to Top
Hit ID E-value Description
AT2G40970.11e-07G2-like family protein