![]() |
PlantRegMap/PlantTFDB v5.0
Plant Transcription
Factor Database
|
Home TFext BLAST Prediction Download Help About Links PlantRegMap |
Phylogenetic Tree for
Catharanthus roseus
MYB FamilyPhylogenetic tree for domain ? help Back to Top |
---|
Subtree rooted at node 216: /----- cra_locus_9214_iso_1/67-111 (4) | /---------99--------+----- cra_locus_14079_iso_4/67-111 (9) | | | \----- cra_locus_54612_iso_1/90-119 (100) | | /-------------------- cra_locus_2164_iso_2/64-108 (32) /-91-+ | | | | /----- cra_locus_32635_iso_1/92-137 (41) | | | /-68-+ | | | | \----- cra_locus_14567_iso_2/78-123 (47) | \-90-+ /-59-+ | | | \---------- cra_locus_15316_iso_1/66-111 (132) | | | | | |--------------- cra_locus_24525_iso_1/96-141 (85) | | | | \-95-+--------------- cra_locus_11573_iso_2/67-110 (117) | | | |--------------- cra_locus_16789_iso_1/111-151 (118) | | | \--------------- cra_locus_34959_iso_1/57-99 (127) | | /----- cra_locus_10674_iso_1/77-120 (14) |-----------83-----------+ | \----- cra_locus_21650_iso_1/67-110 (24) | | /----- cra_locus_19513_iso_1/55-100 (16) |-----------89-----------+ | \----- cra_locus_931_iso_4/67-112 (136) | | /----- cra_locus_11419_iso_1/70-111 (19) | /--------100--------+ | | \----- cra_locus_33_iso_2/71-111 (128) | | | | /-------------------- cra_locus_33217_iso_1/93-130 (46) |-67-+ | | | | /----- cra_locus_10258_iso_3/52-95 (67) | | | /-88-+ | \-95-+ | \----- cra_locus_14002_iso_2/83-126 (129) | | /-97-+ | | | \---------- cra_locus_77219_iso_1/41-84 (70) | \-55-+ | \--------------- cra_locus_11766_iso_2/73-117 (76) | | /----- cra_locus_13905_iso_1/104-149 (22) | /-100+ | | \----- cra_locus_4143_iso_4/67-112 (65) | /-66-+ | | \---------- cra_locus_27637_iso_1/63-108 (92) |------59------+ | \--------------- cra_locus_37275_iso_1/55-97 (28) | | /----- cra_locus_22402_iso_1/68-113 (23) |-----------63-----------+ | \----- cra_locus_20743_iso_1/76-121 (120) | | /----- cra_locus_13046_iso_2/90-135 (27) |-----------73-----------+ | \----- cra_locus_15678_iso_2/67-111 (135) | | /----- cra_locus_14605_iso_1/170-213 (31) /--58-+ /-99-+ | | | \----- cra_locus_45277_iso_1/95-138 (139) | | /-100+ | | | \---------- cra_locus_44780_iso_1/69-111 (130) | | | | | |--------------- cra_locus_12556_iso_1/65-107 (35) | | | | | /-52-+--------------- cra_locus_15360_iso_1/78-122 (53) | | | | | | | |--------------- cra_locus_6371_iso_1/93-135 (150) | | | | | | | \--------------- cra_locus_16251_iso_2/110-153 (111) | | | | | | /----- cra_locus_13788_iso_3/68-110 (34) | | | /-92-+ | |----62---+ | \----- cra_locus_94_iso_6/68-110 (58) | | |----76---+ | | | \---------- cra_locus_7528_iso_1/62-104 (170) | | | | | | /----- cra_locus_12041_iso_4/162-205 (64) | | | /-78-+ | | | | \----- cra_locus_17092_iso_1/141-183 (160) | | \----95---+ | | \---------- cra_locus_8075_iso_4/81-124 (141) | | | |------------------------------ cra_locus_43361_iso_1/51-94 (33) | | | | /----- cra_locus_7205_iso_5/67-112 (50) /-100+ |-----------100----------+ | | | \----- cra_locus_6581_iso_4/84-129 (55) | | | | | | /-------------------- cra_locus_33480_iso_2/95-137 (51) | | | | | | | | /----- cra_locus_9136_iso_5/71-113 (66) | | | | /-100+ | | | | | \----- cra_locus_20822_iso_4/55-97 (137) | | |----93---+ | | | | | /-100+ /----- cra_locus_17842_iso_1/55-97 (82) | | | | | | | | | | | | \-84-+----- cra_locus_14962_iso_1/69-111 (114) | | | \-100+ | | | | | \----- cra_locus_18518_iso_1/69-111 (124) | | | | | | | \--------------- cra_locus_29527_iso_1/54-96 (140) /-51-+ | | | | | |------------------------------ cra_locus_5160_iso_3/67-112 (69) | | | | | | | |------------------------------ cra_locus_112_iso_7/58-103 (80) | | | | | | | | /----- cra_locus_8899_iso_1/90-133 (91) | | | |-----------76-----------+ | | | | \----- cra_locus_23164_iso_1/98-141 (98) | | | | | | | \------------------------------ cra_locus_6705_iso_3/66-106 (134) | | | | | | /----- cra_locus_1156_iso_1/59-103 (95) | | \--------------100-------------+ | | \----- cra_locus_3682_iso_1/59-103 (120) | | | | /----- cra_locus_12041_iso_4/110-156 (79) | \-----------------95----------------+ | \----- cra_locus_17092_iso_1/89-135 (138) | | /--------------- cra_locus_11853_iso_1/255-301 (7) | | |--------------63--------------+ /---------- cra_locus_11853_iso_1/309-352 (20) | | | | \-50-+ /----- cra_locus_12041_iso_4/58-104 (25) | \-100+ | \----- cra_locus_17092_iso_1/37-83 (90) | | /----- cra_locus_10655_iso_3/106-150 (11) | | | /-95-+----- cra_locus_183_iso_2/121-165 (84) | | | | | \----- cra_locus_13768_iso_1/134-178 (125) /-94-+ | | | /-100+---------- cra_locus_531_iso_11/134-178 (48) | | | | | | | | /----- cra_locus_1542_iso_4/124-168 (71) | | | \-62-+ | | /---------58---------+ \----- cra_locus_6373_iso_1/134-178 (93) | | | | | | | | /----- cra_locus_7663_iso_3/1042-1082 (77) | | | \----99---+ | | | \----- cra_locus_7663_iso_3/823-864 (97) | | | | | | /----- cra_locus_183_iso_2/11-54 (17) | | | /----59---+ | | | | \----- cra_locus_13768_iso_1/8-55 (133) | | | | | | | | /----- cra_locus_1542_iso_4/24-70 (21) | |----95---+ | /-64-+ | | | /-63-+ | \----- cra_locus_6373_iso_1/28-73 (96) | | | | |-100+ | | | | | \---------- cra_locus_531_iso_11/24-69 (49) | | | /-59-+ | /-58-+ | | | | \--------------- cra_locus_10655_iso_3/7-50 (44) | | | | | | | | | | /-82-+ \-------------------- cra_locus_14162_iso_1/681-725 (54) | | | | | | | | | | | \------------------------- cra_locus_14162_iso_1/555-596 (113) | | | \--72-+ | | | | /----- cra_locus_802_iso_2/60-103 (86) | | | \-----------99-----------+ | | | \----- cra_locus_11853_iso_1/204-247 (142) | | | | | | /----- cra_locus_8075_iso_4/31-75 (36) | | \-------------------53-------------------+ | | \----- cra_locus_802_iso_2/8-53 (72) | | | | /----- cra_locus_16251_iso_2/57-102 (5) /-87-+ | /-100+ | | | | \----- cra_locus_15360_iso_1/26-71 (74) | | | | | | | |---------- cra_locus_7528_iso_1/8-53 (10) | | | | | | | |---------- cra_locus_6371_iso_1/39-84 (57) | | \-------------------89-------------------+ | | |---------- cra_locus_12556_iso_1/11-56 (62) | | | | | |---------- cra_locus_13788_iso_3/14-59 (83) --95-+ | | | | \---------- cra_locus_94_iso_6/14-59 (116) | | | | /----- cra_locus_14605_iso_1/118-163 (13) | | | | \------------------------99------------------------+----- cra_locus_44780_iso_1/17-62 (75) | | | \----- cra_locus_45277_iso_1/43-88 (130) | | /----- cra_locus_1156_iso_1/4-53 (61) \--------------------------100--------------------------+ \----- cra_locus_3682_iso_1/4-53 (123) Root part of tree: /------------------------------------------------------------------ cra_locus_20822_iso_4/1-48 (1) | |------------------------------------------------------------------ cra_locus_9136_iso_5/17-64 (190) | |------------------------------------------------------------------ cra_locus_29527_iso_1/2-47 (143) | | /-------- cra_locus_14962_iso_1/14-62 (3) | /---84--+ | | \-------- cra_locus_17842_iso_1/2-48 (37) |------------------------70-----------------------+ | \---------------- cra_locus_18518_iso_1/14-62 (15) | | /---------------- cra_locus_9214_iso_1/14-61 (2) | | | /---75---+ /-------- cra_locus_54612_iso_1/37-84 (52) | | \--100--+ | /--100--+ \-------- cra_locus_14079_iso_4/14-61 (78) | | | | | \------------------------- cra_locus_2164_iso_2/11-58 (8) | /---64--+ | | | /-------- cra_locus_21650_iso_1/14-61 (26) | | \-----------100----------+ | /-------97-------+ \-------- cra_locus_10674_iso_1/24-71 (43) | | | | | | /-------- cra_locus_33_iso_2/14-61 (29) | | \---------------100--------------+ | | \-------- cra_locus_11419_iso_1/14-61 (30) | | + |---------------------------------------------------------- (216) | | | | /-------- cra_locus_19513_iso_1/2-49 (6) | |------------------------85-----------------------+ | | \-------- cra_locus_931_iso_4/14-61 (39) | | | |---------------------------------------------------------- cra_locus_13905_iso_1/16-47 (12) | | | | /-------- cra_locus_24525_iso_1/7-43 (18) | | /---80--+ | | | \-------- cra_locus_15316_iso_1/13-60 (56) | | /---96---+ | | | | /-------- cra_locus_32635_iso_1/39-86 (140) | | | \--100--+ | | /-------84------+ \-------- cra_locus_14567_iso_2/25-72 (110) | | | | | | | | /-------- cra_locus_11573_iso_2/14-61 (60) | | | \-------79-------+ | | | \-------- cra_locus_34959_iso_1/2-49 (122) | | | | | /---57--+ /------------------------- cra_locus_33217_iso_1/37-84 (42) | | | | | | | | | | /-------- cra_locus_10258_iso_3/2-46 (63) | | | | /---58--+ /---76--+ | | | | | | | \-------- cra_locus_77219_iso_1/6-35 (81) | | | | | \---71---+ | |---82---+ \---87--+ \---------------- cra_locus_14002_iso_2/30-77 (112) | | | | \---62--+ | \--------------------------------- cra_locus_11766_iso_2/20-67 (89) | | | | /-------- cra_locus_8899_iso_1/37-84 (73) | \-------------------100------------------+ | \-------- cra_locus_23164_iso_1/45-92 (88) | | /-------- cra_locus_6581_iso_4/31-78 (38) |-----------------------100-----------------------+ | \-------- cra_locus_7205_iso_5/14-61 (119) | | /-------- cra_locus_4143_iso_4/14-61 (40) |------------------------89-----------------------+ | \-------- cra_locus_27637_iso_1/10-57 (59) | | /-------- cra_locus_6705_iso_3/13-60 (45) | /---53--+ | | \-------- cra_locus_37275_iso_1/1-48 (180) |-------------------100-------------------+ | \---------------- cra_locus_5160_iso_3/14-61 (94) | |---------------------------------------------------------- cra_locus_15678_iso_2/14-61 (68) | |---------------------------------------------------------- cra_locus_13046_iso_2/37-84 (87) | |---------------------------------------------------------- cra_locus_43361_iso_1/1-45 (99) | | /---------------- cra_locus_16789_iso_1/53-100 (110) | | |--------------------83-------------------+ /-------- cra_locus_20743_iso_1/23-70 (121) | \--100--+ | \-------- cra_locus_22402_iso_1/15-62 (131) | |---------------------------------------------------------- cra_locus_33480_iso_2/19-88 (115) | \---------------------------------------------------------- cra_locus_112_iso_7/5-52 (126) |
Phylogenetic tree for protein ? help Back to Top |
---|
/------------------------------------------------------------------- cra_locus_10674_iso_1 (1) | |------------------------------------------------------------------- cra_locus_21650_iso_1 (25) | | /------- cra_locus_20822_iso_4 (2) | /-----99-----+ | | \------- cra_locus_9136_iso_5 (3) | | | /--50--+ /------- cra_locus_14962_iso_1 (45) | | | /--87-+ | | | | \------- cra_locus_17842_iso_1 (55) | /--------100--------+ \--100-+ | | | \------------- cra_locus_18518_iso_1 (68) | | | | | \--------------------------- cra_locus_29527_iso_1 (51) | | | | /------- cra_locus_1156_iso_1 (4) | |------------------100------------------+ | | \------- cra_locus_3682_iso_1 (70) | | | | /------- cra_locus_15678_iso_2 (5) | | /--76-+ | | | \------- cra_locus_13046_iso_2 (63) | | /--59--+ | | | \------------- cra_locus_33480_iso_2 (64) | |------------51------------+ | | | /------- cra_locus_19513_iso_1 (37) | | \-----98-----+ | | \------- cra_locus_931_iso_4 (50) | | | | /------- cra_locus_34959_iso_1 (7) | |-------------------70------------------+ | | \------- cra_locus_11573_iso_2 (8) | | | | /------- cra_locus_94_iso_6 (9) | | /--93-+ | | | \------- cra_locus_13788_iso_3 (20) | | /--100-+ | | | \------------- cra_locus_7528_iso_1 (11) | | | | | /--64--+ /------- cra_locus_16251_iso_2 (17) | | | | /-100-+ | | | | | \------- cra_locus_15360_iso_1 (26) | | /--86-+ \--100-+ | | | | \------------- cra_locus_12556_iso_1 (44) | | | | | | | \--------------------------- cra_locus_6371_iso_1 (62) | | /--59--+ | | | | /------------- cra_locus_44780_iso_1 (16) | | | | | | | | \--------100--------+ /------- cra_locus_14605_iso_1 (28) | | | \--98-+ | |--67--+ \------- cra_locus_45277_iso_1 (38) | | | | | | /------- cra_locus_17092_iso_1 (35) | | | /-100-+ | | | | \------- cra_locus_12041_iso_4 (69) | | \------------62------------+ | | \------------- cra_locus_8075_iso_4 (53) | | + |----------------------------------------------- cra_locus_43361_iso_1 (12) | | | | /-------------------- cra_locus_27637_iso_1 (13) | | | | | | /------- cra_locus_6705_iso_3 (14) | | /--86--+ /--69-+ | | | | | \------- cra_locus_5160_iso_3 (52) | | | \--89--+ | | /--76-+ \------------- cra_locus_37275_iso_1 (59) | /--53--+ | | | | | /--85--+ \--------------------------- cra_locus_4143_iso_4 (33) | | | | | | | | | \--------------------------------- cra_locus_13905_iso_1 (30) | | | | | | | | /------- cra_locus_14002_iso_2 (31) | | | | /--68-+ | | | | | \------- cra_locus_10258_iso_3 (36) | | | | /--100-+ | | | | | \------------- cra_locus_77219_iso_1 (66) | | | | /--97--+ | | | | | | /------- cra_locus_33217_iso_1 (40) | | | | | \-----79-----+ | | |--50--+ /--75-+ \------- cra_locus_11766_iso_2 (42) | | | | | | | | | | | | /------- cra_locus_23164_iso_1 (56) | | | | | \--------100--------+ | | | |--51--+ \------- cra_locus_8899_iso_1 (58) | | | | | | | | | | /------- cra_locus_20743_iso_1 (34) | | | | \------------88-----------+ | | | | \------- cra_locus_22402_iso_1 (48) | | | | | | | | /------- cra_locus_6581_iso_4 (54) | | | \---------------100--------------+ | | | \------- cra_locus_7205_iso_5 (65) | | | | | | /---------------------------------------- cra_locus_11853_iso_1 (18) | | | | | | | | /--------------------------- cra_locus_10655_iso_3 (19) | | | | | | | | | | /------------- cra_locus_6373_iso_1 (21) | /--57-+ |--54--+ | | | | | | | /-100-+ /--100-+ /------- cra_locus_531_iso_11 (22) | | | | | | | | \--86-+ | | | | | | | | \------- cra_locus_1542_iso_4 (46) | | | | | | \--73--+ | | | | \--66--+ | /------- cra_locus_13768_iso_1 (29) | | | | | \-----98-----+ | | | | | \------- cra_locus_183_iso_2 (32) | | | | | | | | | \--------------------------------- cra_locus_802_iso_2 (43) | | | | | | | | /------- cra_locus_14162_iso_1 (23) | | | |-------------------62------------------+ | | | | \------- cra_locus_16789_iso_1 (24) | | | | | | | | /------- cra_locus_24525_iso_1 (27) | | | |-------------------57------------------+ | | | | \------- cra_locus_15316_iso_1 (67) \--100-+ | | | | | /------- cra_locus_32635_iso_1 (41) | | |------------------100------------------+ | | | \------- cra_locus_14567_iso_2 (60) | | | | | |----------------------------------------------- cra_locus_7663_iso_3 (49) | | | | | \----------------------------------------------- cra_locus_112_iso_7 (61) | | | | /------- cra_locus_54612_iso_1 (10) | | /-100-+ | | | \------- cra_locus_14079_iso_4 (39) | | /--100-+ | | | \------------- cra_locus_9214_iso_1 (47) | \---------------100---------------+ | \-------------------- cra_locus_2164_iso_2 (57) | | /------- cra_locus_33_iso_2 (6) \-------------------------100------------------------+ \------- cra_locus_11419_iso_1 (15) |