PlantTFDB
PlantRegMap/PlantTFDB v5.0
Plant Transcription Factor Database
Phylogenetic Tree for
Setaria italica
HD-ZIP Family
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      /------------------------------------------------------------------- Seita.4G029000.1.p/88-142  (1)
      |                                                                               
      |------------------------------------------------------------------- Seita.4G029200.1.p/115-169 (42)
      |                                                                               
      |                                 /--------------------------------- Seita.5G326100.1.p/93-148  (2)
      |                                 |                                             
      |                                 |                          /------ Seita.2G114000.1.p/63-117  (3)
      |                                 |               /----89----+                  
      |                                 |               |          \------ Seita.7G060900.1.p/67-118  (34)
      |                                 |               |                             
      |                           /--53-+          /-64-+          /------ Seita.8G063700.1.p/67-122  (19)
      |                           |     |          |    |     /-100+                  
      |                           |     |          |    |     |    \------ Seita.7G061100.1.p/67-122  (48)
      |                           |     |    /--63-+    \--53-+                       
      |                           |     |    |     |          \----------- Seita.7G063300.1.p/62-114  (33)
      |                           |     |    |     |                                  
      |                           |     \-95-+     \---------------------- Seita.5G344800.1.p/112-166 (5)
      |                           |          |                                        
      |                           |          \---------------------------- Seita.2G112400.1.p/54-103  (47)
      |                           |                                                   
      |                           |                                /------ Seita.2G282200.1.p/123-178 (14)
      |                           |                           /-86-+                  
      |                     /--99-+                           |    \------ Seita.7G203300.1.p/101-157 (30)
      |                     |     |-------------94------------+                       
      |                     |     |                           \----------- Seita.5G079000.1.p/99-154  (39)
      |                     |     |                                                   
      |                     |     |                                /------ Seita.4G084600.1.p/16-71   (15)
      |                     |     |---------------97---------------+                  
      |                     |     |                                \------ Seita.1G335800.1.p/17-72   (20)
      |                     |     |                                                   
      |                     |     |                                /------ Seita.6G039900.1.p/100-156 (21)
      |                     |     |                                |                  
      |                     |     |                           /-100+------ Seita.6G072700.1.p/108-163 (26)
      |                /-100+     |                           |    |                  
      |                |    |     \-------------78------------+    \------ Seita.7G246700.1.p/105-161 (38)
      |                |    |                                 |                       
      |                |    |                                 \----------- Seita.9G309800.1.p/138-193 (32)
      |                |    |                                                         
      +                |    |                                      /------ Seita.3G395000.1.p/23-80   (4)
      |                |    |                                 /-81-+                  
      |                |    |                                 |    \------ Seita.5G141300.1.p/16-74   (16)
      |                |    |                           /--90-+                       
      |          /--70-+    |                           |     \----------- Seita.9G158800.1.p/30-87   (12)
      |          |     |    \------------100------------+                             
      |          |     |                                |          /------ Seita.9G219700.1.p/29-86   (41)
      |          |     |                                \----56----+                  
      |          |     |                                           \------ Seita.9G572600.1.p/27-85   (49)
      |          |     |                                                              
      |          |     |                                      /----------- Seita.2G284000.1.p/30-84   (18)
      |          |     |                                      |                       
      |          |     \------------------99------------------+    /------ Seita.1G253700.1.p/48-101  (31)
      |          |                                            \-93-+                  
      |          |                                                 \------ Seita.7G184600.1.p/58-111  (45)
      |          |                                                                    
      |          |                                                 /------ Seita.9G248400.1.p/73-126  (8)
      |          |                                            /-100+                  
      |     /-100+                                            |    \------ Seita.9G511500.1.p/69-121  (25)
      |     |    |                                            |                       
      |     |    |                                      /--88-+----------- Seita.6G187700.1.p/54-107  (17)
      |     |    |                                      |     |                       
      |     |    |                                      |     \----------- Seita.2G236800.1.p/47-100  (27)
      |     |    |                                 /-87-+                             
      |     |    |                                 |    |          /------ Seita.9G258100.1.p/136-188 (28)
      |     |    |                                 |    \----99----+                  
      |     |    |                                 |               \------ Seita.9G524200.1.p/113-166 (37)
      |     |    |                           /--68-+                                  
      |     |    |                           |     |               /------ Seita.6G145000.1.p/83-136  (35)
      |     |    |                           |     |          /-96-+                  
      |     |    |                           |     |          |    \------ Seita.2G193200.1.p/91-146  (40)
      |     |    \-------------55------------+     \----96----+                       
      |     |                                |                \----------- Seita.1G306100.1.p/72-125  (46)
      |     |                                |                                        
      |     |                                |                     /------ Seita.9G503700.1.p/58-111  (11)
      |     |                                \---------100---------+                  
      |     |                                                      \------ Seita.2G368600.1.p/58-111  (36)
      |     |                                                                         
      \--97-+                                      /---------------------- Seita.5G241600.1.p/76-129  (6)
            |                                      |                                  
            |                                      |    /----------------- Seita.1G201700.1.p/163-217 (7)
            |                                      |    |                             
            |                                      |    |          /------ Seita.1G088000.1.p/109-163 (9)
            |                                      |-90-+     /-100+                  
            |                                      |    |     |    \------ Seita.1G087900.1.p/110-164 (43)
            |                                      |    \-100-+                       
            |                                /--68-+          \----------- Seita.4G245400.1.p/94-148  (23)
            |                                |     |                                  
            |                                |     |---------------------- Seita.6G176400.1.p/170-224 (13)
            |                                |     |                                  
            |                                |     |               /------ Seita.9G301000.1.p/98-152  (24)
            |---------------50---------------+     |-------99------+                  
            |                                |     |               \------ Seita.9G481800.1.p/116-170 (29)
            |                                |     |                                  
            |                                |     \---------------------- Seita.2G224000.1.p/244-298 (44)
            |                                |                                        
            |                                \---------------------------- Seita.9G321500.1.p/176-235 (10)
            |                                                                         
            \------------------------------------------------------------- Seita.7G187800.1.p/75-129  (22)
                                                                                      

Phylogenetic tree for protein ? help Back to Top
      Subtree rooted at node 86:

                                                                    /----- Seita.9G572600.1.p (2)
                                                          /----99---+                 
                                                          |         \----- Seita.9G219700.1.p (32)
                                                          |                           
                           /--------------100-------------+    /---------- Seita.5G141300.1.p (22)
                           |                              |    |                      
                           |                              \-99-+    /----- Seita.3G395000.1.p (23)
                           |                                   \-100+                 
                           |                                        \----- Seita.9G158800.1.p (46)
                           |                                                          
                           |                                        /----- Seita.1G335800.1.p (3)
                           |                                   /-100+                 
                           |                                   |    \----- Seita.4G084600.1.p (28)
                           |         /-----------100-----------+                      
                           |         |                         \---------- Seita.9G309800.1.p (40)
                           |         |                                                
                           |         |                              /----- Seita.2G112400.1.p (8)
                           |         |              /------100------+                 
                           |         |              |               \----- Seita.2G114000.1.p (36)
                     /--94-+         |              |                                 
                     |     |         |              |          /---------- Seita.7G063300.1.p (11)
                     |     |         |         /-100+          |                      
                     |     |         |         |    |     /-100+    /----- Seita.7G061100.1.p (12)
                     |     |         |         |    |     |    \-100+                 
                     |     |         |         |    \-100-+         \----- Seita.8G063700.1.p (16)
                     |     |    /-64-+    /-99-+          |                           
                     |     |    |    |    |    |          \--------------- Seita.7G060900.1.p (43)
                     |     |    |    |    |    |                                      
                     |     |    |    |-99-+    \-------------------------- Seita.2G282200.1.p (27)
                     |     |    |    |    |                                           
                     |     |    |    |    |                         /----- Seita.7G203300.1.p (9)
                     |     |    |    |    \-----------100-----------+                 
                     |     |    |    |                              \----- Seita.5G079000.1.p (17)
                     |     |    |    |                                                
                     |     \-94-+    |                    /--------------- Seita.5G344800.1.p (13)
                     |          |    |                    |                           
                     |          |    \---------56---------+    /---------- Seita.6G072700.1.p (19)
                     |          |                         |    |                      
                     |          |                         \-100+    /----- Seita.6G039900.1.p (34)
                     |          |                              \-100+                 
                     |          |                                   \----- Seita.7G246700.1.p (47)
                     |          |                                                     
                /-100+          \----------------------------------------- Seita.5G326100.1.p (31)
                |    |                                                                
                |    |                                              /----- Seita.6G145000.1.p (5)
                |    |                                         /-72-+                 
                |    |                                         |    \----- Seita.1G306100.1.p (24)
                |    |                                    /-100+                      
                |    |                                    |    \---------- Seita.2G193200.1.p (18)
                |    |                              /--99-+                           
                |    |                              |     |         /----- Seita.9G524200.1.p (10)
                |    |                              |     \---100---+                 
                |    |                              |               \----- Seita.9G258100.1.p (49)
                |    |                         /-98-+                                 
                |    |                         |    |               /----- Seita.6G187700.1.p (14)
                |    |                         |    |          /-100+                 
                |    |                         |    |          |    \----- Seita.2G236800.1.p (29)
           /-77-+    |                         |    \----87----+                      
           |    |    |                         |               |    /----- Seita.9G511500.1.p (30)
           |    |    |                    /-100+               \-100+                 
           |    |    |                    |    |                    \----- Seita.9G248400.1.p (44)
           |    |    |                    |    |                                      
           |    |    |                    |    |               /---------- Seita.2G284000.1.p (6)
           |    |    |                    |    |               |                      
           |    |    \---------86---------+    \------100------+    /----- Seita.7G184600.1.p (25)
           |    |                         |                    \-100+                 
      --75-+    |                         |                         \----- Seita.1G253700.1.p (37)
           |    |                         |                                           
           |    |                         |                         /----- Seita.9G503700.1.p (26)
           |    |                         \-----------100-----------+                 
           |    |                                                   \----- Seita.2G368600.1.p (45)
           |    |                                                                     
           |    \--------------------------------------------------------- Seita.5G241600.1.p (33)
           |                                                                          
           |                                                        /----- Seita.4G029000.1.p (15)
           \---------------------------99---------------------------+                 
                                                                    \----- Seita.4G029200.1.p (35)
                                                                                      
      Root part of tree:

      /------------------------------------------------------------------- Seita.4G245400.1.p (1)
      |                                                                               
      |                                                       /----------- Seita.1G088000.1.p (20)
      |--------------------------100--------------------------+                       
      |                                                       \----------- Seita.1G087900.1.p (38)
      |                                                                               
      |                                            /---------------------- (86)
      |                                            |                                  
      +                                 /----79----+          /----------- Seita.9G321500.1.p (41)
      |                                 |          \----100---+                       
      |                     /-----89----+                     \----------- Seita.7G187800.1.p (42)
      |                     |           |                                             
      |                     |           \--------------------------------- Seita.1G201700.1.p (4)
      |          /----97----+                                                         
      |          |          |                                 /----------- Seita.6G176400.1.p (7)
      |          |          \---------------100---------------+                       
      \----100---+                                            \----------- Seita.2G224000.1.p (48)
                 |                                                                    
                 |                                            /----------- Seita.9G301000.1.p (21)
                 \---------------------100--------------------+                       
                                                              \----------- Seita.9G481800.1.p (39)