PlantTFDB
PlantRegMap/PlantTFDB v5.0
Plant Transcription Factor Database
Spirodela polyrhiza
Transcription Factors
The gene annotaion from MIPS/IBIS(v2) is used to identify transcription factors (TFs) of Spirodela polyrhiza (See datasource). Acorrding to the family assignment rules,
1046
TFs (
1046
loci) are identified and classified into
57
 families. You can download the TF list (here) and protein sequences of TFs (here), or download them on the download page.
Browse by Family
AP2 (14) ARF (16) ARR-B (7) B3 (21) BBR-BPC (5)
BES1 (8) C2H2 (61) C3H (31) CAMTA (6) CO-like (10)
CPP (5) DBB (5) Dof (26) E2F/DP (5) EIL (4)
ERF (65) FAR1 (14) G2-like (32) GATA (20) GRAS (20)
GRF (6) GeBP (8) HB-PHD (2) HB-other (9) HD-ZIP (23)
HRT-like (1) HSF (13) LBD (33) LFY (1) LSD (3)
M-type_MADS (25) MIKC_MADS (18) MYB (81) MYB_related (53) NAC (55)
NF-X1 (2) NF-YA (5) NF-YB (11) NF-YC (9) Nin-like (12)
RAV (2) S1Fa-like (2) SAP (2) SBP (16) SRS (5)
STAT (1) TALE (16) TCP (16) Trihelix (26) VOZ (1)
WOX (12) WRKY (43) Whirly (3) YABBY (6) ZF-HD (8)
bHLH (94) bZIP (48)